Changes

From Genome Analysis Wiki
Jump to navigationJump to search
416 bytes added ,  16:48, 12 April 2015
Line 95: Line 95:  
</pre>
 
</pre>
    +
</pre>
 
  gene.name.out p.value.out statistic.out no.site.out beta1.est.out beta1.sd.out maf.cutoff.out direction.burden.by.study.out direction.meta.single.var.out top.singlevar.pos
 
  gene.name.out p.value.out statistic.out no.site.out beta1.est.out beta1.sd.out maf.cutoff.out direction.burden.by.study.out direction.meta.single.var.out top.singlevar.pos
 
  [1,] "LDLR"        "0.01916"  "5.487"      "25"        "-0.3575"    "0.1526"    "0.05"        "--"                          "---++-+--+-+++++--+++++-+"  "19:11200309"     
 
  [1,] "LDLR"        "0.01916"  "5.487"      "25"        "-0.3575"    "0.1526"    "0.05"        "--"                          "---++-+--+-+++++--+++++-+"  "19:11200309"     
 
     top.singlevar.refalt top.singlevar.pval top.singlevar.af
 
     top.singlevar.refalt top.singlevar.pval top.singlevar.af
 
  [1,] "C/A"                "0.01047"          "0.01538"       
 
  [1,] "C/A"                "0.01047"          "0.01538"       
     pos.ref.alt.out  
+
     pos.ref.alt.out  
 
+
 
  [1,]"19:11200093/T/C,19:11200213/G/A,19:11200235/G/A,19:11200272/C/A,19:11200282/G/A,19:11200309/C/A,19:11200412/C/T,19:11200419/C/T,19:11200431/C/T,19:11200442/G/A,
+
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             
    19:11200475/C/G,19:11200508/G/A,19:11200514/C/T,19:11200557/G/A,19:11200579/C/T,19:11200728/C/T,19:11200753/T/C,19:11200754/G/A,19:11200806/C/T,19:11200839/T/A,
+
  [1,]"19:11200093/T/C,19:11200213/G/A,19:11200235/G/A,19:11200272/C/A,19:11200282/G/A,19:11200309/C/A,19:11200412/C/T,19:11200419/C/T,19:11200431/C/T,19:11200442/G/A,19:11200475/C/G,
    19:11200840/C/A,19:11200896/C/T,19:11201259/G/C,19:
+
  19:11200508/G/A,19:11200514/C/T,19:11200557/G/A,19:11200579/C/T,19:11200728/C/T,19:11200753/T/C,19:11200754/G/A,19:11200806/C/T,19:11200839/T/A,19:11200840/C/A,19:11200896/C/T,
 +
  19:11201259/G/C,19:11201274/C/T,19:11201275/A/T"
 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
 
                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    
 
</pre>
 
</pre>
98

edits

Navigation menu