Changes

From Genome Analysis Wiki
Jump to navigationJump to search
1 byte added ,  17:50, 13 April 2015
Line 99: Line 99:     
   ###result can be explored as below###
 
   ###result can be explored as below###
   
   > names(res31)
 
   > names(res31)
 
   [1] "p.value"            "ref"                "alt"                "integratedData"    "raw.data"           
 
   [1] "p.value"            "ref"                "alt"                "integratedData"    "raw.data"           
Line 107: Line 106:  
   [21] "nearby"            "cochranQ.stat"      "cochranQ.df"        "cochranQ.pVal"      "I2"                 
 
   [21] "nearby"            "cochranQ.stat"      "cochranQ.df"        "cochranQ.pVal"      "I2"                 
 
   [26] "log.mat"            "pos"               
 
   [26] "log.mat"            "pos"               
> print(res31$pos)
+
  > print(res31$pos)
 
   [1] "19:11200093" "19:11200213" "19:11200235" "19:11200272" "19:11200282" "19:11200309" "19:11200412" "19:11200419"
 
   [1] "19:11200093" "19:11200213" "19:11200235" "19:11200272" "19:11200282" "19:11200309" "19:11200412" "19:11200419"
 
   [9] "19:11200431" "19:11200442" "19:11200475" "19:11200508" "19:11200514" "19:11200557" "19:11200579" "19:11200728"
 
   [9] "19:11200431" "19:11200442" "19:11200475" "19:11200508" "19:11200514" "19:11200557" "19:11200579" "19:11200728"
 
   [17] "19:11200753" "19:11200754" "19:11200806" "19:11200839" "19:11200840" "19:11200896" "19:11201124" "19:11201259"
 
   [17] "19:11200753" "19:11200754" "19:11200806" "19:11200839" "19:11200840" "19:11200896" "19:11201124" "19:11201259"
 
   [25] "19:11201274" "19:11201275"
 
   [25] "19:11201274" "19:11201275"
> print(res31$p.value)
+
  > print(res31$p.value)
 
   [1]        NA        NA        NA        NA 0.9223267        NA        NA        NA        NA        NA        NA        NA
 
   [1]        NA        NA        NA        NA 0.9223267        NA        NA        NA        NA        NA        NA        NA
 
   [13]        NA        NA        NA        NA        NA        NA        NA        NA        NA        NA        NA        NA
 
   [13]        NA        NA        NA        NA        NA        NA        NA        NA        NA        NA        NA        NA
98

edits

Navigation menu