Changes

From Genome Analysis Wiki
Jump to navigationJump to search

DosageConvertor (view source)

Revision as of 19:17, 6 June 2016

61 bytes removed ,  19:17, 6 June 2016
no edit summary
Line 34: Line 34:  
  make
 
  make
   −
For e.g. to calculate LD the command should be: <code>
     −
Usage: ./DosageConvertor  --vcfDose      TestDataImputedVCF.dose.vcf.gz
+
Usage: ./DosageConvertor  --vcfDose      TestDataImputedVCF.dose.vcf.gz
 
                           --info        TestDataImputedVCF.info
 
                           --info        TestDataImputedVCF.info
 
                           --prefix      OutputFilePrefix
 
                           --prefix      OutputFilePrefix
Line 47: Line 46:  
                           --idDelimiter  _              // Delimiter to Split VCF Sample ID into
 
                           --idDelimiter  _              // Delimiter to Split VCF Sample ID into
 
                                                           // FID and IID for PLINK format
 
                                                           // FID and IID for PLINK format
−
</code>
+
 
     
Santy.8128
487

edits

Retrieved from "http://genome.sph.umich.edu/wiki/Special:MobileDiff/14198"

Navigation menu