Changes

From Genome Analysis Wiki
Jump to navigationJump to search
Line 179: Line 179:  
Under the vcf/chrXX directory, there should be:
 
Under the vcf/chrXX directory, there should be:
 
* chrXX.filtered.sites.vcf
 
* chrXX.filtered.sites.vcf
* chrXX.filtered.sites.vcf.log
+
* chrXX.filtered.sites.vcf.norm.log
 
* chrXX.filtered.sites.vcf.summary
 
* chrXX.filtered.sites.vcf.summary
 
* chrXX.filtered.vcf.gz
 
* chrXX.filtered.vcf.gz
 
* chrXX.filtered.vcf.gz.OK
 
* chrXX.filtered.vcf.gz.OK
 
* chrXX.filtered.vcf.gz.tbi
 
* chrXX.filtered.vcf.gz.tbi
 +
* chrXX.hardfiltered.sites.vcf
 +
* chrXX.hardfiltered.sites.vcf.log
 +
* chrXX.hardfiltered.sites.vcf.summary
 +
* chrXX.hardfiltered.vcf.gz
 +
* chrXX.hardfiltered.vcf.gz.OK
 +
* chrXX.hardfiltered.vcf.gz.tbi
 
* chrXX.merged.sites.vcf
 
* chrXX.merged.sites.vcf
 
* chrXX.merged.stats.vcf
 
* chrXX.merged.stats.vcf
14

edits

Navigation menu