Changes

From Genome Analysis Wiki
Jump to navigationJump to search
4 bytes added ,  16:37, 12 April 2015
Line 96: Line 96:     
  gene.name.out p.value.out statistic.out no.site.out beta1.est.out beta1.sd.out maf.cutoff.out direction.burden.by.study.out direction.meta.single.var.out top.singlevar.pos
 
  gene.name.out p.value.out statistic.out no.site.out beta1.est.out beta1.sd.out maf.cutoff.out direction.burden.by.study.out direction.meta.single.var.out top.singlevar.pos
[1,] "LDLR"        "0.01916"  "5.487"      "25"        "-0.3575"    "0.1526"    "0.05"        "--"                          "---++-+--+-+++++--+++++-+"  "19:11200309"     
+
[1,] "LDLR"        "0.01916"  "5.487"      "25"        "-0.3575"    "0.1526"    "0.05"        "--"                          "---++-+--+-+++++--+++++-+"  "19:11200309"     
 
     top.singlevar.refalt top.singlevar.pval top.singlevar.af
 
     top.singlevar.refalt top.singlevar.pval top.singlevar.af
[1,] "C/A"                "0.01047"          "0.01538"       
+
[1,] "C/A"                "0.01047"          "0.01538"       
 
     pos.ref.alt.out                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
 
     pos.ref.alt.out                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   
[1,]"19:11200093/T/C,19:11200213/G/A,19:11200235/G/A,19:11200272/C/A,19:11200282/G/A,19:11200309/C/A,19:11200412/C/T,19:11200419/C/T,19:11200431/C/T,19:11200442/G/A,19:11200475/C/G,19:11200508/G/A,
+
[1,]"19:11200093/T/C,19:11200213/G/A,19:11200235/G/A,19:11200272/C/A,19:11200282/G/A,19:11200309/C/A,19:11200412/C/T,19:11200419/C/T,19:11200431/C/T,19:11200442/G/A,19:11200475/C/G,19:11200508/G/A,
19:11200514/C/T,19:11200557/G/A,19:11200579/C/T,19:11200728/C/T,19:11200753/T/C,19:11200754/G/A,19:11200806/C/T,19:11200839/T/A,19:11200840/C/A,19:11200896/C/T,19:11201259/G/C,19:
+
19:11200514/C/T,19:11200557/G/A,19:11200579/C/T,19:11200728/C/T,19:11200753/T/C,19:11200754/G/A,19:11200806/C/T,19:11200839/T/A,19:11200840/C/A,19:11200896/C/T,19:11201259/G/C,19:
 
</pre>
 
</pre>
  
98

edits

Navigation menu