Changes

From Genome Analysis Wiki
Jump to navigationJump to search
Line 360: Line 360:  
View Output file
 
View Output file
 
<div class="mw-collapsible-content" style="width:800px">
 
<div class="mw-collapsible-content" style="width:800px">
  #CHROM BEGIN END MARKER_ID NS FRAC_WITH_RARE NUM_ALL_VARS NUM_PASS_VARS NUM_SING_VARS PVALUE STATRHO
+
  #CHROM BEGIN   END     MARKER_ID       NS     FRAC_WITH_RARE NUM_ALL_VARS   NUM_PASS_VARS   NUM_SING_VARS   PVALUE BETA    SEBETA  ZSTAT
  22 36655735 36661906 22:36655735-36661906_APOL1 62 0.14516 7 4 0 0.42748 1
+
  22     36655735       36661906       22:36655735-36661906_APOL1     62     0.14516 7       4       0       0.28783 0.80648 0.75876 1.0629
  22 36623731 36633107 22:36623731-36633107_APOL2 62 0.064516 4 1 0 0.038657 NA
+
  22     36623731       36633107       22:36623731-36633107_APOL2     62     0.064516       4       1       0       0.99286 -17.704 1978.1  -0.0089502
  22 36537763 36556823 22:36537763-36556823_APOL3 62 0.080645 4 2 0 0.40634 0
+
  22     36537763       36556823       22:36537763-36556823_APOL3     62     0.080645       4       2       0       0.643  -0.44056        0.95048 -0.46351
  22 36587154 36598081 22:36587154-36598081_APOL4 62 0.14516 12 4 0 0.67891 0
+
  22     36587154       36598081       22:36587154-36598081_APOL4     62     0.096774        12     4       0      0.3989  0.76461 0.90638 0.84358
  22 36122356 36124860 22:36122356-36124860_APOL5 62 0.1129 5 2 0 0.15055 0.3
+
  22     36122356       36124860       22:36122356-36124860_APOL5     62     0.1129 5       2       0       0.076266        1.9741  1.1136  1.7728
  22 36900271 36900806 22:36900271-36900806_FOXRED2 NA NA 2 0 0 NA NA
+
  22     36900271       36900806       22:36900271-36900806_FOXRED2   NA     NA     2       0       0       NA      NA      NA     NA
  22 36681163 36710183 22:36681163-36710183_MYH9 62 0.032258 3 1 0 1 NA
+
  22     36681163       36710183       22:36681163-36710183_MYH9       62     0.048387        3       1       0      0.9904  16.668  1385.4  0.012031
  22 36711990 36711990 22:36711990-36711990_Metazoa_SRP NA NA 1 0 0 NA NA
+
  22     36711990       36711990       22:36711990-36711990_Metazoa_SRP       NA     NA     1       0       0       NA     NA      NA      NA
  22 36424450 36424450 22:36424450-36424450_RBFOX2 62 0.032258 1 1 0 1 NA
+
  22     36424450       36424450       22:36424450-36424450_RBFOX2     62     0.032258       1       1       0       1       5.9095e-16      1.4376  4.1107e-16
  22 36792162 36792162 22:36792162-36792162_RP4-633O19__A.1 NA NA 1 0 0 NA NA
+
  22     36792162       36792162       22:36792162-36792162_RP4-633O19__A.1   NA     NA     1       0       0       NA      NA      NA     NA
 
</div>
 
</div>
 
</div>
 
</div>
Line 398: Line 398:  
</div>
 
</div>
 
</div>
 
</div>
      
== Return to Ancestry on your own genome==
 
== Return to Ancestry on your own genome==
 
Let's go see if Ancestry finished: [[SeqShop:_Ancestry_On_Your_Own_Genome,_December_2014#Checking_if_Pileup_finished]]
 
Let's go see if Ancestry finished: [[SeqShop:_Ancestry_On_Your_Own_Genome,_December_2014#Checking_if_Pileup_finished]]
216

edits

Navigation menu